重慶交通大學是國務院學位委員會批準的具有博士、碩士學位授予權的單位。學校于1985年成為國家第三批碩士學位授予單位并開始招收碩士研究生，1998年通過了交通部質量評估檢查；2004年開始聯(lián)合培養(yǎng)博士研究生，2006年成為博士學位授予單位。2009年設立土木工程一級學科博士后科研流動站。

　　學�，F有"土木工程" 等7個省部級重點學科；有交通運輸工程、水利工程、管理科學與工程3個一級學科博士學位授權點，橋梁與隧道工程二級學科博士學位授權點；有馬克思主義理論、地理學、力學、機械工程、材料科學與工程、計算機科學與技術、土木工程、水利工程、測繪科學與技術、交通運輸工程、軟件工程、管理科學與工程、工商管理等13個一級學科碩士學位授權點，系統(tǒng)工程1個二級學科碩士學位授權點。具有建筑與土木工程等9個工程碩士專業(yè)學位培養(yǎng)領域。具有授予同等學力人員碩士學位資格。